此外，这种新型高功率氦氖激光器还可作为激光理疗和光针，它是利用激光的生物刺激效应进行治疗的。它具有明显的消炎、止痛，促进组织再生，增强代谢作用和机体免疫功能，增强病菌对抗生素的敏感性。随着激光功率的提高，更有利于提高疗效、缩短疗程和治疗时间，进一步扩大适应症。有些疾病在采用小功率氦氖激光理疗时，疗效不够明显，但采用高功率氦氖激光时，疗效就会格外明显。例如，伤口不愈合、大面积溃疡、带状泡疹、各种炎症等效果十分显著。如果用高功率氦氖激光在体表直接照射静脉部位，又可以起到低能量氦氖激光血管内照射的治疗作用，对某些疑难杂症(如支气管哮喘、帕金森氏症、脑供血不足等)也有一定疗效。这样不仅使患者免受多次用留置针穿刺静脉的痛苦和可能发生交叉感染的危害，而且还避免由于光纤末端极高的激光功率密度导致与其接触的血液细胞造成不良影响的危害。因此，高功率氦氖激光作血管外照射会具有明显的优越性。
这种新型高功率氦氖激光器可用于光动力治疗、激光理疗、光针、低能量氦氖激光血管内照射等方面的适应症，是一种科技含量高、适应症宽广、便于推广使用的新型激光医疗设备。